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Equipe iRiBio

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Hervé SEZNEC est chargé de Recherche au CNRS/IN2P3. Responsable de l’équipe iRiBio, Hervé Seznec se consacre au développement et à la mise en œuvre de méthodes physiques à partir de microfaisceaux d’ions afin de répondre à des problématiques fondamentales et appliquées dans le domaine des sciences du vivant. Les méthodologies proposées sont multi-modales et multi-échelles car elles visent à obtenir des données biologiques qualitatives, quantitatives, dynamiques et en temps réel tant à l’échelle de la molécule que de le cellule, de l’individu et des populations.

Biologiste de formation (Doctorat en Biologie et génétique moléculaire, titulaire de l’HDR de l’école doctorale Biologie-Santé de l’université de Bordeaux), il utilise des modèles biologiques d’intérêts comme Caenorhabditis elegans afin d’étudier précisément les mécanismes moléculaires et cellulaires induits en réponse à des stress physiques (rayonnements ionisants, nanoparticules d’oxydes métalliques). Aujourd’hui, ses recherches reposent sur une étroite combinaison des méthodes de biologie cellulaire et moléculaire et sur les fortes potentialités techniques de ces instruments en physique des particules (microfaisceau d’ions) afin de caractériser les réponses biologiques induites par de faibles doses d’exposition à des rayonnements ionisants (micro-irradiation contrôlée à l’échelle subcellualire) et/ou par des expositions à des nanoparticules d’oxydes métalliques (micro-analyse quantitative et multi-modale).

Ses recherches s’inscrivent dans les champs d’applications suivants : (i) la connaissance des mécanismes fondamentaux impliqués dans le maintien de l’intégrité des génomes ; (ii) de la radiobiologie moléculaire et cellulaire ; (iii) de la microscopie corrélative et multi-modale ; (iv) des nouvelles approches thérapeutiques anti-cancéreuses (protonthérapie, nanomédecine).
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Dr Hervé Seznec

Responsable de l’équipe iRiBio
Chargé de recherche CNRS - HDR

CENBG - iRiBio
Chemin du solarium
CS10120 - 33175 Gradignan cedex
Tel : +33 (0)557 120 864
Email : seznech chez cenbg.in2p3.fr
Compétences : biologie cellulaire et moléculaire (transfection, QRTPCR,...), microbiologie (Caenorhabditis elegans), vidéo-microscopie en temps réel, microscopie confocale, micro-analyse par faisceau d’ions, microscopie corrélative

Mots- clés : Réparation de l’ADN, radiobiologie cellulaire et moléculaire, nanomédecine, nanotoxicologie, microscopies, Caenorhabditis elegans
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Dans le cadre des programmes de recherche interdisciplinaire du groupe iRiBio, Philippe Barberet se consacre au développement d’outils expérimentaux (microfaisceaux d’ions) et numériques (simulations Monte-Carlo) issus de l’instrumentation nucléaire et appliqués aux recherches en sciences du Vivant. Physicien de formation, P. Barberet a rejoint l’équipe en 2006 après un doctorat au CENBG (2000-2003) et deux ans de post-doctorat à la GSI Darmstadt en Allemagne (2004-2006). P. Barberet s’investit tout particulièrement dans le développement des lignes de faisceau focalisées de la plateforme AIFIRA. Ces méthodes expérimentales de micro-irradiation ciblée et de micro-analyse élémentaire sont utilisées pour caractériser les réponses biologiques radio-induites à l’échelle cellulaire et l’impact de l’exposition à des nanoparticules d’oxydes métalliques sur le vivant.

Domaines d’expertise

Microfaisceaux d’ions, accélérateurs, instrumentation nucléaire, microscopie, micro-analyse élémentaire, simulations Monte-Carlo (Geant4)
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Dr Philippe Barberet

Maître de conférences, HDR

CENBG - iRiBio
Chemin du solarium
CS10120 - 33175 Gradignan cedex
Tel : +33 (0)557 120 903
Email : barberet chez cenbg.in2p3.fr

Enseignements

Responsable du cursus Master en ingénierie “Physique : rayonnements et instrumentation”
Membre du conseil de l’Unité de Formation de physique
Cours, travaux dirigés et travaux pratiques en licences de physique et physique-chimie à l’université Bordeaux.

Cours et travaux expérimentaux en master de physique et master "Matériaux du Patrimoine Culturel et Archéométrie" (Université Bordeaux-Montaigne) : Physique nucléaire, analyse par faisceau d’ions, interaction rayonnement-matière, physique nucléaire médicale, acquisition de données, projets en instrumentation.
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Domaines d’expertise

  • Analyse par faisceaux d’ions PIXE, STIM, RBS
  • Imagerie chimique par µ-fluorescence X et rayonnement synchrotron
  • Spéciation des éléments chimiques XANES, EXAFS
  • Microscopies à épi-fluorescence et microscopie confocale
  • Analyse statistique des données

Curriculum

  • Doctorat de chimie analytique et environnement - Université de Bordeaux (2010)
  • DESS caractérisations microsctructurales des matériaux - Université de Poitiers (1997)
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Dr Guillaume Devès

Ingénieur de recherche CNRS

CENBG - iRiBio
Chemin du solarium
CS10120 - 33175 Gradignan cedex
Tel : +33 (0)557 120 903
Email : deves chez cenbg.in2p3.fr
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Thèmes de recherche


  • Extension de Geant4 dans le cadre du projet Geant4-DNA pour la modélisation des dommages précoces directs et indirects engendrés par les radiations ionisantes.
  • Modélisation des géométries cellulaires réalistes basées sur l’imagerie confocale 3D
  • Modélisation d’environnements radiatifs spécifiques (par ex. à bord de la Station Spatiale Internationale, à la surface de la planète Mars) pour le développement de biopuces destinées à la recherche de traces de vie dans le système solaire. Participation à des campagnes d’irradiation associées.
  • Faisceaulogie à haut pouvoir de focalisation
  • Pilotage du développement de la physique électromagnétique de basse énergie de Geant4.
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    Dr Sébastien Incerti

    Directeur de recherche CNRS
    Porte parole de la collaboration Geant4-DNA
    Directeur du Laboratoire International Associé FKPPL France - Corée du Sud
    Membre du CoNRS, section 01
    Editeur Associé de l’European Journal of Medical Physics - Physica Medica / Elsevier

    CENBG - iRiBio
    Chemin du solarium
    CS10120 - 33175 Gradignan cedex
    Tel : +33 (0)557 120 889
    Email : incerti chez cenbg.in2p3.fr

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    Thèmes de recherche

    • Développement des techniques de tomographie STIM et PIXE
    • Procédures de visualisation et de traitement des données 3D
    • Analyse quantitative 3D

    Dr Claire Michelet

    Responsable pédagogique du Master 2 Pro Instrumentation Nucléaire
    Maître de conférences

    CENBG - iRiBio
    Chemin du solarium
    CS10120 - 33175 Gradignan cedex
    Tel : +33 (0)557 120 898
    Email : michelet chez cenbg.in2p3.fr
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    Titulaire d’un Master en Physique Médicale de l’Université Paul Sabatier-Toulouse III, Eva TORFEH a rejoint le groupe iRIBIO en novembre 2016 afin de réaliser son doctorat en Physique à l’Université de Bordeaux (école doctorale Science Physique et de l’ingénieur, directeur de thèse Philippe BARBERET). Dans le cadre des études en radiobiologie effectuées par le groupe iRiBio, le projet de thèse d’Eva vise à définir et caractériser précisément la dosimétrie à l’échelle cellulaire et les différents observables physiques d’intérêt pour les différentes irradiations expérimentales sur des cellules humaines (in vitro) et sur un organisme vivant « C.elegans » (in vivo). Il s’agit pour Eva de développer des modèles micro-dosimétriques pour aboutir à la définition de ces différents observables physiques : dose locale, dépôts d’énergie, spectres des particules secondaires, structure de traces, etc... L’intérêt est de pouvoir corréler ces simulations numériques aux réponses biologiques observées suite aux irradiations. Ces simulations sont réalisées à l’aide de l’outil Monte Carlo Geant4 et de son extension pour la micro-dosimétrie Geant4-DNA) .

    Compétences : Simulation Monte-Carlo (Geant4 et Geant4-DNA), microscopie confocale et traitement d’image (ImageJ), culture et maintenance de C.elegans, traitement des données (Python)

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    Eva Torfeh

    Doctorante

    CENBG - iRiBio
    Chemin du solarium
    CS10120 - 33175 Gradignan cedex
    Tel : +33 (0)557 120 864
    Email : torfeh chez cenbg.in2p3.fr
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    Wook Geun Shin est doctorant en co-tutelle entre l’Université de Bordeaux et l’Université de Yonsei en Corée du Sud (2017-2020). Son activité se focalise sur le développement de nouveaux modèles physiques pour Geant4-DNA et sur l’extension de Geant4-DNA pour la modélisation des dommages biologiques précoces et tardifs. Il est membre du Laboratoire International Associé France-Corée du Sud FKPPL.
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    Wook-Geun Shin

    Doctorant

    CENBG - iRiBio
    Chemin du solarium
    CS10120 - 33175 Gradignan cedex
    Tel : +33 (0)557 120 889
    Email : shin chez cenbg.in2p3.fr
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    Dr Franck Gobet

    Professeur
    Directeur de l’école doctorale SPI

    CENBG - iRiBio
    Chemin du solarium
    CS10120 - 33175 Gradignan cedex
    Tel : +33 (0)557 120 876
    Email : gobet chez cenbg.in2p3.fr
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    Dr Philippe Moretto

    Professeur
    Vice Président Recherche de l’université de Bordeaux

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